Epistasis and the changing fitness landscapes of SARS-CoV-2
この論文は、SARS-CoV-2 の変異データを用いて、異なる変異株間の遺伝的背景の違いがエピスタシス（遺伝的相互作用）を通じて変異の適応度コストを変化させ、パンデミック期間中に適応度地形がどのように変遷したかを解明したことを示しています。
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evolutionary biology
261 件の論文
進化生物学は、生命がどのように時間とともに変化し、多様な姿を形成してきたかを解き明かす分野です。遺伝子の働きから種間の関係まで、過去の証拠と現在の観察を結びつけることで、私たちの存在のルーツに迫ります。
Gist.Science は、bioRxiv から投稿される進化生物学の新しいプレプリントをすべて収集し、専門用語を噛み砕いた解説と、技術的な詳細をまとめた要約の両方をご用意しています。これにより、専門家だけでなく広く一般の方々が、最先端の研究成果をスムーズに理解できます。
以下に、進化生物学の最新プレプリントの一覧をご紹介します。
Biophysical trade-offs in antibody evolution are resolved by conformation-mediated epistasis
本研究は、ヒト細胞上で全长抗体の多様な生物物理的性質を同時に定量する新規プラットフォームを開発し、SARS-CoV-2 に対する抗体進化において、立体構造の再編成によるコンフォメーション媒介のエピスタシスが、生物物理的トレードオフを解決し、限られた進化経路を可能にすることを明らかにしました。
Population structure can reduce clonal interference when sexual reproduction and dispersal are synchronized
この論文は、分散と有性生殖が同期することで、空間的構造が遺伝的多様性を維持し、異なる集団間の個体間での組換えを促進することで、クローン干渉を軽減し適応速度を向上させることを示しています。
Guarding versus self-guarding in innate immunity
数理モデルを用いた解析により、自己監視（self-guarding）は病原体の抑制を迅速化する一方で誤作動（自己免疫）のリスクが高まるため、独立した監視者と被監視者からなるシステムがより一般的に進化してきたと結論付けています。
Demographic history shapes forest tree vulnerability to climate change
本研究は、6 種のヨーロッパ産森林樹種を対象とした集団ゲノム解析を通じて、歴史的な遺伝的隔離や分断が遺伝的多様性の低下や遺伝的負荷の増加を招き、気候変動に対する適応能力を減退させて樹木の脆弱性を高めることを明らかにしました。
Inferring Migration Networks with Time-Lagged F2 Statistics
この論文は、中立対立遺伝子頻度の時間的線形進化と拡張 F2 統計量に基づく線形回帰法を開発し、古代 DNA 時系列データから系統集団間の方向的な移住率を推定することで、過去 6000 年間の人類移動ネットワークを再構築する手法を提案しています。
Experimental Evolution of Yeast Reveals Trade-offs Between Early and Late Stationary Phase
本論文は、酵母の実験的進化を通じて、定常期初期と後期のパフォーマンス間にトレードオフが存在し、定常期の長さによって適応経路や突然変異の効果が異なることを明らかにした。
Spider mite genotypes with higher growth rate suffer more from competition but exert stronger reproductive interference
この研究は、ハダニの個体群内における遺伝的変異が、競争感受性と生殖的干渉の強さの間にトレードオフを生み出し、種間相互作用の生態学と進化を理解する上でこれらの形質間の遺伝的相関を考慮することが重要であることを示しています。
The role of miscarriage and sororal birth order in male same-sex orientation: Theoretical predictions and empirical data
この研究は、男性の同性指向における兄弟順序効果（特に姉の影響）と流産の役割を理論モデルと 8 地域の実証データで検証し、流産を考慮したモデルがデータの一部を説明できるものの、推定される流産率が現実の報告値を上回るなど、母体免疫仮説だけでは完全には説明できない矛盾が残っていることを示しています。
Characterizing Physicochemical Selection in Protein Evolution with Property-Informed Models (PRIME)
本研究は、アミノ酸の物理化学的性質を明示的に組み込んだ新しい進化モデル「PRIME」を開発し、従来のモデルでは捉えきれなかったタンパク質進化の物理的基盤と適応メカニズムを解明したことを示しています。